CLASSIFICAZIONE DEI VIRUS

I virus sono suddivisi a seconda dell'ospite parassistato in:

virus del batteri o batteriofagi

virus dei vegetali

virus degli animali → suddivisi a loro volta in: - virus degli artropodi ;

- virus dei vertebrati ;

Nell'ambito dei gruppi i diversi virus sono classificati in:

• famiglie, suffisso -viridae
• sottofamiglie, suffisso -virinae
• generi, suffisso -virus

Le diverse famiglie sono distinte a seconda del tipo di acido nucleico:

• Deossiribovirus genoma DNA
• Ribovirus genoma RNA

Nell'ambito dei Deossibirovirus il genoma è formato da singola molecola di acido nucleico e le famiglie sono distinte in base alla presenza o meno di pepleos e alla struttura del genoma:

molecola di DNA bicatenario lineare

molecola di DNA bicatenario circolare → Papovavirdae

molecola di DNA monocatenario lineare → (1 sola catena polinucleotidica) Parvoviridae

molecola di DNA circolare e parzialmente bicatenaria → Hepadnaviridae

Nell'ambito dei Ribovirus, le famiglie sono differenziate oltre che x la presenza o meno di peplos, anche x la struttura del genoma:

1 sola molecola linerare di RNA monocatenaria

distinte (da 2 a 12) molecole di RNA rappresentano dei minicromosomi (genoma segmentato)

RNA bicatenario -> famiglia Reoviridae (è anche segmentato)

- genoma diploide -> 2 identiche molecole di RNA lineare monocatenario, nei Retroviridae

molecole di RNA monocatenario forma circolare -> Arenaviridae

DEOSSIBIBOVIRUS

POXVIRIDAE

• virus di > dimensioni  300-450 x 170-260 nm
• Forma: ovoidale
• complesso rivestimento formato da strutture ricche di lipidi ad aspetto tubulare ed una struttura interna composta da un core centrale contenente il DNA e 2 corpi laterali.
• Genoma -> molecola di DNA bicatenario e lineare
• centinaio di proteine strutturali  (quindi numerosi antigeni)
• numerosi enzimi nel virione (poli-A polimerasi, DNA topoisomerasi I, RNA.metil-trasferasi; una trascriptasi necessaria alla sintesi degli mRNA precoci del ciclo replicativo.
• Liberazione dei virioni neoformati avviene con lisi della cell infetta
• L'uomo unico ospite del virus del vaiolo (genere Orthomyxovirus) eradicato dal pianeta.
• Virus del mollusco contagiosi (genere Molluscipoxvirus) l'unico poxvirus oggi presente nell'uomo. L'infezione si accompagna alla comparsa di lesioni cutanee nodulari o pustole.

HERPESVIRIDAE

• Dimensioni 150-200 nm
• Forma: rotondeggiate
• Formato da: - peplos; - tegumento ( spazio compreso tra la faccia interna del peplos e la periferia del nucleo-capside, è occupata da proteine virus specifiche "matrice" le quali formano un ulteriore involucro); - capside icosaedrico; - nucleoide formato da una sorta di rocchetto proteico intorno al quale è avvolto il DNA.
• Genoma : molecola di DNA bicatenario e lineare. Sono presenti corte sequenze di basi che si ripetono nello stesso ordine ad 1 o a tutti e 2 gli estremi della molecola (possono favorire la circolarizzazione del genoma subito dopo il suo rilascio dal capside).
• Presenti 30 proteine strutturali (un certo numero di proteine del peplos sono glicosilate). In alcuni casi nelle proteine del pleplos sono prensenti proteine con i caratteri di recettori x i frammenti Fc delle Ig.
• Gli Herpesvirus comprendono 3 sottofamiglie:

I ) Alfaherpesvirus → ampio spettro d'ospite, effetto citopatico e produzione di

inclusioni nucleari; Herpesvirus simplex 1 e 2 ; Virus

della Varicella-Zoster.

II ) Betaherpesvirus → spettro d'ospite specie-specifici; si replicano in vitro in colture di fibroblasti della specie animale sensibile. Ciclo di replicazione lento. Producono inclusioni nucleari e citoplasmatiche. Citomegalovirus umano ; Herpesvirus umano 6 e 7

III ) Gammaherpesvirus → spettro d'ospite ristretto e si replicano esclusiv in

cellule linfoidi.Virus di Epstein-Barr Herpesvirus

umano 8

• Gli Herpesvirus superata la fase acuta di infezione, tendono a instaurare un'infezione latente che dura x tutta la vita del paziente infetto con possibili  riesarcebazioni periodiche.
• Alcuni sono dotati di potere oncogeno.

ADENOVIRIDAE

• Dimensioni : 70-90 nm
• Non hanno peplos, capside icosaedrico. I capsomeri disposti ai vertici (pentoni) presentano proiezioni filamentose rigide (fibre) in cui risiedono i principali antigeni tipo-specifici; gli esoni sono la sede degli antigeni comuni.
• Genoma : molecola di DNA bicatenario e linere
• Virioni hanno 10 proteine strutturali
• L'assemblaggio dei virioni avviene nel nucleo con formazione di ammassi cristallini e la liberazione avviene attraverso la lisi della cellula.
• La > parte sono specie-specifici. Diversi tipi sierologici e gli adenovirus umani indicati con lettera h (human). Gli adenovirus umani (h1-h47) sostengono una patologia varia a localizzazione respiratoria o enterica.
• Alcuni sierotipi sono oncogeni.

PAPILLOMAVIRIDAE e POLYOMAVIRIDAE

• Genoma : formato da 1 molecola di DNA bicatenario a struttura circolare
• Virioni a simmetria icosaedrica, privi di pepleos
• La replicazione ha luogo nel nucleo della cell e il virus si libera con lisi della cell
• Classificati in 2 distinte famiglie (papillomaviridae e polyomaviridae) ciascuna con un unico genere: - Papillomavirus→ . dimensioni : 55nm

. Genoma: può codificare 10 proteine e 2 sono strutturali

. specie-specifici, difficile la replic in vitro

. 70 diversi tipi classificati in base all'analisi del DNA,

responsabili di verie manifestazioni tumorali benigne ->

conditomi, verruche, papillomi, sulla cute e sulle

mucose); alcuni tipi sono correlati a neoplasie maligne ->

caricama dell'apparato genitale femminile.

- Polyomavirus → . Dimensioni: 45 nm

. Genoma : codificare 8 proteine, 3 sono prot strutturali

. correlati alla leucoencefalopatia multifocale

progressiva (virus JC) e ad infezioni renali o respiratorie

(virus BK).

HEPADNAVIRIDAE

• Virus epatici a DNA (comprendono il vurus dell'epatite B umana)

Dimensioni : 42 nm + involucro lipidico 18nm

• Nell'involucro lipidico presenti proteine virus specifiche che contengono gli antigeni (Ag) di superficie (s) del virus HB (HBsAg). Nelle proteine del nucleo-capside presenti gli antigeni del core (HbcAg). Le proteine strutturali rappresentate da 2 proteine che formano l' HBsAg e da 1 proteina che forma l'HbcAg.
• Genoma: molecola di DNA circolare solo parzialmente bicatenaria che nel virione maturo (extracell) è caratterizzato dall'assenza di un tratto di una delle catene nucleotidiche.
• Virus ha uno spiccato tropismo x gli epatociti
• Il meccanismo di replicazione richiede un intermedio replicativo formato da RNA e la sua successiva trascrizione inversa in DNA (simile ai Retrovirus).
• L'infezione da Hepadnavirus è associata alla comparsa di tumori primitivi del fegato.

PARVOVIRIDAE

• Dimensioni : 18-26 nm sono i + piccoli tra i desossiribovirus.
• Privo di pleplos, capside a simmetria icosaedrica contiene a 2 a 4 tipi di proteine strutturali.
• 2 sottofamiglie: a quella dei Parvovorinae appartengono i parvovirus che infettano i vertebrati. Questa sottofamiglia è divisa in 3 generi: 1) Parvovirus -> virus animali; 2) Erythrovirus -> comprende il virus umano B19; 3) Dependo-virus -> virus adenoassociati.
• Genoma : singola cellula di DNA monocatenario e lineare. Le estremità sono sequenze nucleotidiche ripetute e invertite, in grado di ripiegarsi su se stesse in una conformazione a forcina.n
• La replicazione: avviene nel nucleo, la liberazione si esegue con lisi della cellula infetta.
• La > parte dei parvovirus sono virus autonomi, capaci di portare a termine autonomamente il loro ciclo replicativo; i Dependovirus x completare il ciclo replicativo deve essere presente una coinfezione da edenovirus o herpesvirus.
• La > parte è specie-specifica; fra gli Erythrovirus il parvovirus B19 infetta l'uomo e ha rilevanza patologica.

RIBOVIRUS

PARAMYXOVIRIDAE

• Dimensioni: 150-300 nm
• Forma: virioni pleomorfi, forma sferica
• Peplos, all'interno del quale è raggomitolato il nucleocapside elicoidale.
• Genoma: una molecola di RNA monocatenario e lineare, di polarità negativa
• 6-10 proteine strutturali, i virus contengono tutti 1 "trascrittasi" virus-specifica necessaria alla trascrizione del genoma nell'RNA messaggero.
• 2 sottofamiglie: 1) Paramyxovirinae a cui appartengono :

- virus della parotite;

- i 4 tipi di virus parainfluenzale;

- virus del morbillo;

2) Pneumovirinae a cui appartiene: il virus del respiro-sinciziale

ORTHOMIXOVIRIDAE

• Dimensione: 90-120 nm
• Forma : pleomorfo, spesso tondeggiante
• Peplos, racchiude un capside elicoidale. Il peplos rappresenta 2 serie di peplomeri (formati da glicoproteine) in cui sono localizzate le proprietà: 1°) emoagglutinante e fumogena, 2°) neuraminidasica.
• Genoma: 7 (influenza C) o 8 (i influenza A e B) segmenti di RNA monocatenario, lineare, di senso negativo.
• Da 7 a 9 proteine strutturali + una RNA-polimerari RNA-dipendente
• La famiglia degli Orthomyxoviridae è divisa in 4 generi:

I ) Influenza A

II) Influenza B infettano l'uomo

III) Influenza C

IV) Togothovirus: appartengono i virus Togotho e Dhori (trasmessi da zecche)

RHABDOVIRIDAE

• Dimensione: 70-85 nm di larghezza, 130-380 nm di lunghezza
• Forma : virione allungato, forma a proiettile
• Presenta : un involucro lipidico con larghi peplomeri, all'interno il nucleocapside elicoidale è avvolto a spirale a formare una struttura cilindrica
• Genoma: una molecola di RNA monocatenario, lineare, di senso negativo
• 4-5 proteine principali, + una RNA-polimerari RNA-dipendente
• Replicazione: citoplasmatica e la liberazione dei nuovi virioni avviene x gemmazione.
• Interesse medico: il genere Lyssavirus -> cui appartiene il virus della Rabbia.

FILOVIRIDAE

• Dimensioni: 80 nm di diametro; fino a 14000 nm di lunghezza
• Forma: allungata, filamentosa, ripiegati a forma di "6", di "U".
• Peplos con larghi peplomeri, che circonda un nucleocapside elicoidale rigido.
• Genoma : una molecola di RNA monocatenario, lineare, di senso negativo.
• 7 proteine strutturali principali + una RNA-polimerari RNA-dipendente
• Replicazione: nel citoplasma e i virioni si liberano x gemmazione.
• Comprendono i virus Marburg e Ebola, isolati dall'uomo in alcuni episodi di "febbri emorragiche".

ARENAVIRIDAE

Dimensioni: 50-300 nm

Forma: tondeggiante

Peplos con evidenti peplomeri che racchiudono 2 nucleocapsidi elicoidali e di forma circolare (uno + grande e uno + piccolo) in cui sono contenute le 2 molecole di RNA monocatenario, di senso negativo e circolari

3 principali proteine strutturali: 1 forma i 2 capsidi e 1 (glicosilata) forma i peplomeri dell'involucro esterno. Nel virione è presente una una RNA-polimerari RNA-dipendente.

All'interno del virione sono presenti alcuni ribosomi, che sono passivamente inglobati durante il processo morfogenetico e nn hanno funzionalità.

Replicazione: nel citoplasma e si liberano x gemmazione

Sono parassiti dei roditori, la trasmissione all'uomo, zoonosi è legata a particolari situazioni ecologico-ambientali ed è seguita da gravi manifestazioni morbose: febbri-emorragiche, corio-meningite linfocitaria.

BUNYAVIRIDAE

• Dimensioni: 90-120 nm
• Forma: circolare
• Peplos provvisto di fini peplomeri che racchiudono all'interno 3 nucleocapsidi elicoidali a struttura circolare e di dimensioni diverse (uno grande, uno medio, uno piccolo), che racchiudono le 3 molecole di RNA, monocatenario, di senso negativo ed a struttura circolare.
• 4 proteine strutturali, una RNA-polimerari RNA-dipendente
• Replicazione: nel citoplasma , l'assemblaggio dei virioni avviene x gemmazione attraverso le membrane lisce dell'apparato del Golgi.
• Genere Hantavirus -> responsabile di una febbre emorragica con complicazioni renali.

REOVIRIDAE

• Dimensioni: 60-80nm
• Forma: sprovvisto di peplos, presenta 2 involucri causidici, entrambi con simmetria icosaedrica
• Genoma: formato da RNA bicatenario, presente in forma di 10 (genere Reovirus), 11 (genere Rotavirus), 12 (genere virus della febbre da zecche del Colorado) segmenti separati.
• 10-12 proteine strutturali + una RNA-polimerari RNA-dipendente
• Replicazione: è citoplasmatica, con formazione di inclusioni in cui i virus neoformati sono spesso disposti in ammassi regolari (cristallini).

RETROVIRUS

• Dimensioni: 80-130nm
• Forma : quasi sferica
• Peplos con peplomeri evidenti che racchiudono un capside e un nucleo-capsidecon organizzazione elicoidale.
• Genoma: diploide, xchè formato da 2 molecole di RNA monocatenario, di senso positivo.
• 7-8 proteine strutturali; le proteine del peplos contengono antigeni specie specifici mentre le proteine intere hanno antigeni di gruppo. Nell'enzima è presente una "trascrittasi inversa" o una DNA-polimerari RNA-dipendente essenziale x il ciclo replicativo del virus.
• Replicazione: sequenza di eventi caratteristici -> 1) trascrizione inversa di ciascuna molecola di RNA del virus in una molecola di DNA bicatenario che si integra nel genoma della cell infettata; 2) da questo viene poi trascritto l'RNA messaggero virus specifico sia i genomi x la nuova progenie virale. L'assemblaggio avviene nel citoplasma contemporaneamente all'acquisizione del peplos mediante gemmazione attraverso la membrana cellulare.
• I retrovirus sono divisi in 7 generi:

retrovirus di tipo B

retrovirus di tipo C                          comprendono virus oncogeni

retrovirus di tipo D  

retrovirus del gruppo HTLV

lentivirus e spumavirus

CORONAVIRIDAE

• Dimensioni: 80-160nm
• Forma: virione pleomorfo, forma rotondeggiante
• Peplos con peplomeri ben evidenti di forma tozza e grossa che formano una "corona" intorno al virione, che racchiude un nucleocapside elicoidale.
• Genoma: molecola di RNA monocatenario, di senso positivo, infettante.
• 3 proteine strutturali (2 glicosilate che formano i peplomeri).
• Replicazione: nel citoplasma, gemmazione attraverso membrane intracitoplasmatiche.
• 2 Coronavirus (229-E e OC43) sono associati a manifestazioni delle vie respiratorie dell'uomo (raffreddore comune, faringite, polmonite). Un coronavirus è stato identificato come agente eziologico della SARS

TOGAVIRIDAE

• Dimensioni : 60-70 nm
• Forma: rotondeggiante
• Peplos con fini peplomeri che racchiude un capside a simmetria icosaedrica.
• Genoma: una molecola di RNA, monocatenario, di senso positivo, infettante.
• 3-4 proteine strutturali (1-2 glicosilate)
• Replicazione: nel citoplasma, liberazione x gemmazione attraverso la membrana cellulare.
• Il genere Alphavirus, comprende numerosi virus trasmessi da artropodi (zanzare); il genere Rubivirus cui appartiene il virus della Rosolia.

FLAVIVIRIDAE

• Dimensioni: 40-50 nm
• Forma: rotondeggiante
• Peplos con peplomeri sottili, che racchiude un capside sferico.
• Genoma: una molecola di RNA monocatenario, di senso positivo, infettante.
• 3 proteine strutturali (1 glicosilata)
• Replicazione: nel citoplasma, dove il virus acquista il peplos gemmando attraverso alcune membrane cellulari.
• Molti flavovirus sono trasmessi da artropodi (zanzare, zecche). Virus della febbre gialla; virus dellepatite C.

CALICIVIRIDAE

• Dimensioni: 35-40nm
• Forma: a calice Sprovvisti di peplos , capside icosaedrico
• Genoma: una molecola di RNA monocatenario, a senso positivo, infettante,
• 1 proteina strutturale (forma il 98% delle subunità proteiche del capside)
• Replicazione: nel citoplasma, lisi della cell
• Alcuni calicivirus sono implicati in manifestazioni gastro-enteriche umane con sintomatologia diarroica o con vomito incoercibile. Virus dell'epatite E .

ASTROVIRIDAE

• Dimensioni: 28-30 nm
• Forma: sprovvisti di peplos, con capside icosaedrico
• Genoma: una molecola di RNA con polarità positiva
• 2-3 proteine strutturali
• Replicazione: nel citoplasma, sono frequenti ammassi cristallini di virioni neoformati
• Gli Astrovirus umani comprendono 5 diversi tipi antigeni e sono implicati in manifestazioni diarroiche.

PICORNAVIRIDAE

• Dimensioni: 28-30 nm sono i + piccoli tra i ribovirus
• Forma: sprovvisti di peplos, con capside isometrico
• Genoma: una molecola di RNA, monocatenario, di senso positivo, infettante.
• 4proteine strutturali
• Replicazione: nel citoplasma, lisi della cell
• I Picornavirus sono specie-specifici e comprendono il genere Enterovirus, circa 70 tipi antigeni interessano esclusivamente l'uomo:

- poliovirus 1,2,3

- coxsackievirus A1-A22, A24, B1-B6

- echovirus 1-9, 11-27, 29-34

- enterovirus umani 68-71

il genere Rhinovirus oltre 100 tipi antigeni sono in grado di provocare manifestazioni

morbose delle prime vie aeree (raffreddore comune)

i generi Aphtovirus (virus dell'afta epizoica)

il virus dell'epatite A

VIRUS NON CLASSIFICATI

Virus delta si trovano spesso associati al virus dell'epatite B, ha caratteri che lo avvicinano agli RNA-satelliti presenti nel regno vegetale (piccole molecole di RNA monocatenario, a struttura circolare; nella molecola sono presenti sequenze palindromiche che consentono la formazione di tratti di RNA bicatenario, quando la circolarità della molecola venga interrotta e la molecola si ripieghi su se stessa )

Prioni dotati di potere infettante, responsabili di una serie di encefalopatie spongiformi degli animali ( e dell'uomo). Sono formati da proteine in grado di riprodursi e completamente privi di acidi nucleici.